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ucsc数据库?ucsc数据库中有水稻数据库吗

编程之家2023-10-22105次浏览

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UCSC是生物领域里常用的数据库之一,由University of California Santa Cruz(UCSC)创立和维护,主要包含了人类、小鼠、果蝇等多种常见动物的基因组信息。UCSC里也包括了一系列的分析工具,帮助用户浏览基因信息、查看已有基因组注释信息和下载基因序列等。

在生物信息分析过程中,有时会需要fasta、GTF或BED等格式的数据文件,而UCSC是这些文件的主要下载来源之一。本文主要以人的基因组信息为例讲述如何在UCSC上下载想要的数据库和交叉数据库。

UCSC主界面如图所示,我们找到Table Browser点击进入。

常用的医学数据库有哪些

常用的医学数据库如下:

1、sciencedirect爱思唯尔(Elsevier)是医学与其他科学文献出版社之一。爱思唯尔出版2500余种期刊,包括《柳叶刀》、《四面体》、《细胞》。39000多种电子书籍以及诸多经典参考书如《格雷氏解剖学》等。还推出了ClinicalKey临床精钥、Embase(生物医学、药理学)检索工具。

2、PubMed是一个免费的搜寻引擎,提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要的数据库。它的数据库来源为MEDLINE。

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3、OVID Technologies公司是世界著名的数据库提供商,目前OVID平台包涵生物医学的数据库有临床各科专著及教科书、循证医学、MEDLINE、EMBASE以及医学期刊全文数据库等。

4、《美国医学会杂志》(JAMA)国际知名的医学杂志之一。《JAMA》中文版其常设栏目有:原著、综述、共识报告、特讯、医学进展、约翰霍普金森医院大巡诊、临床抉择、临床心脏病学、医学新闻与展望、述评等。

5、UpToDate临床顾问数据库是用于协助临床医生进行诊疗上的判断、决策的循证医学数据库。

6、Wiley成立于1807年,是全球最大的学术出版商之一,Wiley Online Library上有19种生物学、生命科学和生物医学的实验室指南(Current Protocols),17种化学、光谱和循证医学数据库(Cochrane Library)。

跟CNV分析有关的数据:DGV(基因组变异数据库)、Decipher(拷贝数变异数据库)、ClinGen数据库(剂量敏感判断数据库)、UCSC Genome Browser(基因组浏览器)。

番茄数据库如何找染色体长度

在UCSC的主页上,点击Genomics,然后点击human图标,获取其他物种的染色体长度。

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染色体(chromosome)是细胞在有丝分裂或减数分裂时DNA存在的特定形式。细胞核内,DNA紧密卷绕在称为组蛋白的蛋白质周围并被包装成一个线状结构。当细胞不分裂时,染色体在细胞核中是不可见的——在显微镜下也是如此。

关于ucsc数据库的内容到此结束,希望对大家有所帮助。

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