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基因组数据库,基因数据库有哪些

编程之家2023-10-2198次浏览

大家好,今天来为大家分享基因组数据库的一些知识点,和基因数据库有哪些的问题解析,大家要是都明白,那么可以忽略,如果不太清楚的话可以看看本篇文章,相信很大概率可以解决您的问题,接下来我们就一起来看看吧!

基因组数据库,基因数据库有哪些

核酸序列数据库和基因组数据库的区别

核酸序列数据库(genbank)和基因组数据库(ensemble)的区别:

1、GenBank

是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。

2、Ensemble数据库可为药物研发提供超过167,000种生物活性化合物包括化学结构在内的必要信息。本数据库利用用户容易掌握的界面将数据、文本和图象资料有机地结合起来,便于查询。Ensemble可从药品专利开始,再通过其临床前和临床研究资料,直至注册信息、市场概况及其他方面的相关资料来跟踪药物。数据库每月更新一次,每年增加约10,000

种新化合物。

基因组数据库的简介

基因组数据库是分子生物信息数据库的重要组成部分。基因组数据库内容丰富、名目繁多、格式不一,分布在世界各地的信息中心、测序中心、以及和医学、生物学、农业等有关的研究机构和大学。基因组数据库的主体是模式生物基因组数据库,其中最主要的是由世界各国的人类基因组研究中心、测序中心构建的各种人类基因组数据库。小鼠、河豚鱼、拟南芥、水稻、线虫、果蝇、酵母、大肠杆菌等各种模式生物基因组数据库或基因组信息资源都可以在网上找到。随着资源基因组计划的普遍实施,几十种动物、植物基因组数据库也纷纷上网,如英国Roslin研究所的ArkDB包括了猪、牛、绵羊、山羊、马等家畜以及鹿、狗、鸡等基因组数据库,美国、英国、日本等国的基因组中心的斑马鱼、罗非鱼(Tilapia)、青鳉鱼(Medaka)、鲑鱼(Salmon)等鱼类基因组数据库。英国谷物网络组织(CropNet)建有玉米、大麦、高粱、菜豆农作物以及苜蓿(Alfalfa)、牧草(Forage)、玫瑰等基因组数据库。除了模式生物基因组数据库外,基因组信息资源还包括染色体、基因突变、遗传疾病、分类学、比较基因组、基因调控和表达、放射杂交、基因图谱等各种数据库。

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基因组大小查询数据库

转自: https://mp.weixin.qq.com/s/x4p2rrXtZydMdNFiwdbUMg

网址: http://www.genomesize.com/search.php打开网页之后输入查询信息,即可获得基因组大小信息。

网址: https://cvalues.science.kew.org/打开网页之后,需要注意的是菜单栏在页面右侧,选择要查询的选项,页面跳转之后按照要求输入相应的查询信息,即可获得基因组大小信息。

基因组数据库,基因数据库有哪些

网址: http://www.zbi.ee/fungal-genomesize/打开网页之后输入查询信息,即可获得基因组大小信息。

en.wikipedia.org/wiki/List_of_sequenced_genomes

基因数据库有哪些

单核苷酸多态性、结构、性质以及相关描述。

集合所有已知核酸的核苷酸序列,单核苷酸多态性、结构、性质以及相关描述,包括它们的科学命名、来源物种分类名称、参考文献等信息的资料库。

基因和基因组的资料也包含在DNA数据库中。目前国际上比较重要的核酸(含蛋白质)一级数据库有美国的GenBank、欧洲的EMBL和日本的DDBJ。三个数据库信息共享,每日交换,故资料是一样的,唯格式有所不同。

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