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中国水稻数据库 国家水稻数据库里面基因结构怎么看

编程之家2023-10-1983次浏览

大家好,关于中国水稻数据库很多朋友都还不太明白,不过没关系,因为今天小编就来为大家分享关于国家水稻数据库里面基因结构怎么看的知识点,相信应该可以解决大家的一些困惑和问题,如果碰巧可以解决您的问题,还望关注下本站哦,希望对各位有所帮助!

中国水稻数据库 国家水稻数据库里面基因结构怎么看

猪毛草的中国水生维管束植物图谱数据库

Id 96门中文名被子植物门门拉丁名 Angiospermae纲中文名单子叶植物纲纲拉丁名 Monocotyledoneae科中文名莎草科科拉丁名 Cyperaceae种中文名猪毛草种拉丁名 Scirpus wallichii Nees—Scirpus sasaki Hayata生长环境常生于水稻田中或近水处。花期果期花果期6~11月(长江以南)。国内分布分布于云南、贵州、广西、广东、江西、福建、台湾。国外分布朝鲜、日本、印度也有。用途全草药用,有清热利尿之效。

ucsc数据库中有水稻数据库吗

UCSC是生物领域里常用的数据库之一,由University of California Santa Cruz(UCSC)创立和维护,主要包含了人类、小鼠、果蝇等多种常见动物的基因组信息。UCSC里也包括了一系列的分析工具,帮助用户浏览基因信息、查看已有基因组注释信息和下载基因序列等。

在生物信息分析过程中,有时会需要fasta、GTF或BED等格式的数据文件,而UCSC是这些文件的主要下载来源之一。本文主要以人的基因组信息为例讲述如何在UCSC上下载想要的数据库和交叉数据库。

UCSC主界面如图所示,我们找到Table Browser点击进入。

中国水稻科学是国家权威期刊吗

一般国家权威期刊就是主办方为国家级别。但由于目前国家权威期刊的评定标准很多,所以很难说哪个标准更具有权威性,但是有一点是毋庸置疑的,那就是双核期刊一般都是权威期刊。

刊名:中国水稻科学

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ChineseJournalofRiceScience

主办:中国水稻研究所

周期:双月

出版地:浙江省杭州市

语种:中文;英文;

开本:大16开

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ISSN:1001-7216

CN: 33-1146/S

邮发代号:32-94

历史沿革:

现用刊名:中国水稻科学

创刊时间:1986

该刊被以下数据库收录:

CA化学文摘(美)(2011)

JST日本科学技术振兴机构数据库(日)(2012年计划收录)

中国科学引文数据库(CSCD—2008)

核心期刊:

中文核心期刊(2008)

中文核心期刊(2004)

中文核心期刊(2000)

中文核心期刊(1996)

中文核心期刊(1992)

复合影响因子:2.306

综合影响因子:1.401

从这个刊物为双核期刊,加之很高的影响因子可以清晰判断出该刊十分权威,并且主办方也是中国水稻研究所,所以完全可以认为是国家权威期刊。

国家水稻数据库里面基因结构怎么看

可以选择红色方框里的数据库,主要用前面两个:genomic sequence和 CDS sequence。

1、分别是基因组序列和CDS(mRNA)序列。这里选择基因组序列数据库

2、在红色方框里粘贴FASTA格式的序列

3、点击“submit”提交

4、点击blast result中的 accession下的 LOC号,即红色方框的内

5、在以下页面中,即可下载序列(分别有CDS序列和genomic序列),还可以在 genome browser中查看该基因在基因组中染色体的位置等信息,还有基因结构的信息。该图中浅色部分是UTR,深色部分是CDS

6、用genome browser中查看该基因信息,点选track下的general中的DNA/GC content,--->update image,再放大图像即可看到以下结果。

OK,本文到此结束,希望对大家有所帮助。

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