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omim数据库?omim是什么意思

编程之家2023-10-1890次浏览

各位老铁们好,相信很多人对omim数据库都不是特别的了解,因此呢,今天就来为大家分享下关于omim数据库以及omim是什么意思的问题知识,还望可以帮助大家,解决大家的一些困惑,下面一起来看看吧!

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三大核酸数据库的特点

三大核酸数据库的特点分别是:

1、Genome收录的物种涉及所有的生物领域:细菌、古细菌、真核生物,以及许多病毒、噬菌体、类病毒、质粒以及含有遗传物质的细胞器。

2、Gene数据库收录全部已测序物种的基因注释信息,包括基因的名称、染色体定位、基因序列和编码产物(mRNA、蛋白质)情况、基因功能和相关文献信息等,并与GenBank、OMIM、遗传多态数据库(如dbSNP、dbVar)等NCBI子库,及KEGG、GeneOntology等外源性数据库进行交叉引用。

3、GenBank是NIH遗传序列数据库,集成了所有公开可获得的已注释DNA序列,其收录的核酸序列数据根据不同的研究属性,分属于Nucleotide、GSS和EST三个子库。

内含子个数用数据库怎么查

在NCBI上的OMIM数据库输入基因名。

1、NCBI上进入基因的检索条以后,summary里会有相应的ENSEMBL的链接(seerelated)。

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2、直接进入ENSEMBL主页检索该基因。进入基因的检索条以后,点左侧的CDNA和EXONS就能相应地看到转录本的注释信息,包括外显子和内含子的注释。内含子个数用数据库查得在NCBI上的OMIM数据库输入基因名。

omim是什么意思

OMIM是Online Mendelian Inheritance in Man(人类遗传疾病在线遗传目录)的缩写,是一个收集人类遗传疾病信息的数据库。OMIM最初由美国约翰·霍普金斯大学的Huntington Willard教授于1966年创建,现在由Johns Hopkins School of Medicine的McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine管理。该数据库收录了超过2万多种人类遗传疾病的相关遗传、分子和临床特征信息,旨在为医生、研究人员、教育工作者和普通公众提供有关人类遗传疾病的全面知识和信息。

OMIM数据库中包含了很多有用的信息,如人类遗传疾病的遗传模式、病因、症状、临床表现和诊断方法等。此外,OMIM还提供了相关文献的引用,为研究人员提供了有关人类遗传疾病的详细信息。OMIM已经成为医学领域中关于人类遗传疾病的最权威的数据库之一,对临床医生、研究人员和学生的学习和研究工作有着重要的参考价值。

如何使用omim数据库资源

OMIM数据库之父VictorAlmonMcKusick先生是位临床医生。该数据库的最原始的版本是一本叫MIM的遗传学书籍,后来挪到了网上,就加了一个“O”称为在线的人类孟德尔遗传学。所以OMIM数据库不同于其他的NCBI数据库。其设计之初是为临床医生提供在线浏览的服务,因此没有相应的序列下载服务。从另外一个角度来说,OMIM的每一条记录讨论的是某一个基因,而与这个基因相关的序列可能有几条,几十条甚至上百条的记录。

要解决你的问题,如果数量不多,例如50以内。建议你手工通过OMIM提供的RefSeq的链接获取。这个方法的优点是,你可以挑选你想要的序列(mRNA,DNA或Protein),消耗的时间上与编程差不多。

如果超过100,或需要反复做,就有编程的必要。你可以参考我提供的链接使用eUtils工具来获取序列。

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文章到此结束,如果本次分享的omim数据库和omim是什么意思的问题解决了您的问题,那么我们由衷的感到高兴!

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